海南医学院学报杂志文献阅读_MBL2与MASPs家族蛋白质相互作用的生物信息学分析

MBL2与MASPs家族蛋白质相互作用的生物信息学分析

程少文; 陈扬平; 张安强; 彭磊; 梁华平; 吕传柱海南医学院第一附属医院创伤中心; 海南海口570102; 急救与创伤研究教育部重点实验室; 海南海口571199; 陆军军医大学大坪医院野战外科研究所; 创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室; 重庆400042; 海南医学院急诊创伤学院; 海南海口571199

摘要：目的:通过生物信息学方法对甘露糖结合凝集素2(MBL2)蛋白与甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白质的相互作用进行全面预测分析。方法:使用同源建模(Swiss-model)和折叠识别(Phyre2)分别来构建MBL2蛋白与MASPs家族蛋白质的结构,使用STRING数据库及ZDOCK3.02预测分析MBL2与MASP1、MASP2两个蛋白质的相互作用情况。结果: MBL2与MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等构成相互作用网络。MBL2与MASP1结合位点和MASP2的结合位点高度重叠。MBL2参与结合MASP1的残基,大部分(77%)也参与了与MASP2的结合,表明MBL2是通过同一个区域,分别与MASPs家族的蛋白质相互作用。结论: MBL2与MASPs家族蛋白质之间作用密切,从而可能在补体系统激活及机体免疫防御等方面发挥重要的作用。

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